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中科院青岛生物能源与过程研究所等建立微拟球藻数据库支撑“绿色重生”计划

作者: 2020-11-16 16:52 来源:中国科学报
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  为了促进全球微拟球藻研究群体的资源共享和合作、加速工业产油微藻合成生物学和分子育种技术的进展,中科院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心联合来自韩国、德国、美国、法国等国的14个实验室,发布了“微拟球藻设计与合成数据库”(NanDeSyn)。该工作近日发表于《植物学期刊》。

  工业产油微藻能够规模化地利用光能将二氧化碳和水转化为油脂,因此是人类社会粮食、营养和燃料可持续供应的潜在解决方案之一。记者了解到,微拟球藻的单倍体核基因组较少、DNA转化简易可靠、基因组编辑效率高,而且基因表达调控技术灵活多样。

  该数据库系统地收集和整合了包括微拟球藻属内所有种的最新基因组序列、基因注释、转录组、蛋白组、小RNA等的功能基因组学和表观遗传学数据。同时,数据库通过网站提供了基因信息搜索、基因组比对、共线性分析、基因富集分析、代谢通路分析、基因组浏览器等在线数据挖掘工具。此外,研究人员还结合文献调研,展示了每个基因的研究现状,以及相应的基因突变载体和突变株等信息,以支撑这些研究材料的无偿共享。

  据悉,在NanDeSyn数据库的基础上,相关国际合作研究网络将不断拓展,共同推动以微拟球藻为底盘的光驱固碳合成生物学技术,即“绿色重生”研究计划的实施。(记者廖洋 通讯员刘佳) 

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