北京市农林科学院杨效曾研究员课题组与北京大学生命科学院合作，通过对88种覆盖了从低等水生植物到高等被子植物中小分子RNA数据的深度挖掘，对这些植物中的miRNA进行系统鉴定、注释和分析，构建了迄今为止世界上最为综合全面的植物miRNA数据库——PmiREN。该研究成果于10月1日被生命学科领域数据库顶级期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）接收。

据了解，植物miRNA综合数据库——PmiREN有几大突出特点：一是拥有完整的miRNA信息，涵盖了从水生植物到被子植物共88个物种；二是首次发现了大量作物中特异的miRNA，新构建的数据库中第一次发现的miRNA达16000个，其中不少是主要作物如玉米、水稻、小麦等中第一次发现的，这些小RNA潜在与重要的农艺性状相关，挖掘这些小RNA的功能，对改良作物农艺性状将具有重要的应用价值；三是通过综合的数据挖掘，获得了大量miRNA相关的信息，包括miRNA基因簇信息、表达信息、共线性分析结果、靶基因预测结果等，并进行了全面、详实、直观的信息呈现；四是提供了多种数据库检索和搜索的方式，同时用户可以方便地下载数据库中所有的数据。

PmiREN数据库上线后，得到了国内外该研究领域的广泛关注，短短3个月，就接收了全球范围内超过20个国家150多个地区的访问，访问量超过56000次。

来源：《科技日报》

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