创新与应用案例

科学家提出蛋白质三维重构新算法 助力蛋白质结构解析

日期:2022-06-02

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近年来,冷冻电镜技术在测定生物大分子结构方面取得了突破性进展。兰州大学与美国欧道明大学研究人员合作,提出了一种基于球面嵌入的蛋白质三维重构算法,有助于从冷冻电镜图像中重构出更加准确的蛋白质三维结构。相关成果44日发表于《通讯生物学》。

为提升三维重构结果的可靠性,研究人员充分利用了全体投影图像在投影方向以及等价线方面的全体一致性约束,通过两次球面嵌入获得了在三维空间中满足全体投影图像一致性约束的投影方向估计,进而计算出了蛋白质的三维结构。这种方法的特点是不需要初始模板,尽量从数据内部挖掘约束条件,对初始化依赖较小,因而提高了重构结果的可靠性和准确性。

研究人员分别使用了模拟数据集和两组真实数据集对算法进行了评价。通过与目前常见的几种算法进行对比,验证了所提算法的有效性。利用该工作中提出的方法,可以有效改进冷冻电镜三维重构中的关键算法,进而得到更加准确和分辨率更高的蛋白质三维结构。

信息来源:

https://www.nature.com/articles/s42003-022-03255-6

https://news.lzu.edu.cn/c/202204/89031.html?msclkid=aea04987cdb511ecbf8fad9190e7463c

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