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美阿肯色大学开发出确定候选药物与蛋白质结合能力的计算机模型

日期:2023-03-02

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 美国阿肯色大学的研究人员结合计算物理学和实验数据开发了计算机模型,用于确定候选药物靶向结合细胞内蛋白质的能力。相关研究成果于2022年12月29日发表在《自然 计算科学》上,有望大大减少在开发新药方面的成本和时间。

研究人员开发了一个理论框架来估测配体-蛋白质结合情况,该方法为配体在坐标系中的每个网格点都分配了一个有效能量,该能量的原点是配体处于结合状态时最可能的位置。研究人员使用偏差式模拟以及非参数重加权技术来考虑偏差,然后利用一种称为定向四元数形式主义的数学化技术,进一步描述配体与目标蛋白结合时的构象变化。

研究人员通过估计人成纤维细胞生长因子1(一种特殊的信号蛋白)与肝素六糖5(一种流行的药物)之间的结合亲和力来测试这种方法,结果表明,模拟和实验结果之间在性质上有很强的一致性。

信息来源:

https://techxplore.com/news/2023-01-drug-candidate-ability-proteins.html

https://www.nature.com/articles/s43588-022-00389-9

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