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美熨斗研究所利用阿贡超级计算机改善多肽药物制造

日期:2023-07-03

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 HPCwire网2023年4月29日消息,美国熨斗研究所(Flatiron)的研究团队利用阿贡领导力计算设施(ALCF)的超级计算资源改善多肽药物制造,加快新药物研发。

此项研究的目的是为了治疗更广泛的疾病,因为多肽药物结合了小分子药物和蛋白质类药物的某些优势,使它们小到足以穿透和避开免疫系统,但其大小又不会导致它们与预期靶标以外的物质结合,肽基化合物将有望成为一种特别通用的药物。

研究人员利用Theta超级计算机,通过基于物理的模拟和机器学习等技术来推进新型肽化合物的设计,借助Rosetta软件套件来预测和设计蛋白质和肽结构以及预测RNA折叠等。

研究人员指出,肽和蛋白质一样,氨基酸的特定序列决定了分子折叠成特定3D结构的方式,而这种特定的3D结构决定了分子的功能。如果能让一个分子严格折叠成精确的形状,那么就能创造出一种与靶标结合的化合物。

信息来源:

https://www.hpcwire.com/off-the-wire/alcf-supercomputers-help-design-of-peptide-based-drugs-with-quantum-mechanics/

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