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美华盛顿大学研究人员开发出基于强化学习的新型蛋白质设计软件

日期:2023-06-08

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 美国华盛顿大学生物化学教授大卫 贝克团队开发了一款基于“自上而下”强化学习的新型蛋白质设计软件,该软件让具有所需系统特性的复杂蛋白质纳米材料的设计成为可能。实验发现,该方法设计的蛋白质能在小鼠体内产生有用的抗体,这将有助于科学家设计出更有效的疫苗。相关研究成果于2023年4月20日发表在《科学》上。

研究人员通过开发一种“自上而下”的方法来克服“自下而上”的蛋白质复合物设计的局限性。该方法从结构的所需特性(整体对称性、孔隙率等)的规范开始,并系统地构建亚基,将这些亚基组合在一起以优化这些特性。实验证明,该方法设计的蛋白质,不仅准确,还可高度定制,预期和实际纳米结构之间的偏差平均小于单个原子的宽度。

该研究是利用AI进行蛋白质科学研究的里程碑,可帮助研究人员创造出使用以前的方法无法制造的治疗性蛋白质、疫苗和其他分子。

信息来源:

https://www.science.org/doi/10.1126/science.adf6591

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